自然指数（Nature Index）于2014年11月首次发布，是依托于全球顶级期刊，统计各高校、科研院所（国家）在国际上最具影响力的研究型学术期刊上发表论文数量的数据库。自然指数是评价各高校及其它学术机构科研能力的客观量化标准之一，是衡量各单位顶尖学术产出的重要指标，在全球范围内有较大影响力。

自然指数（Nature Index）官网于2026年6月10日发布《2026年自然指数重大变更（Major changes to the Nature Index for 2026）》，有两个重要变化，一是新增18种应用科学期刊（含1种IEEE顶级会议）、15种社会科学期刊；二是主题分类按照论文内容分配，而非按期刊进行分配，且一篇论文仅被一个主题分类纳入统计。

最新版自然指数期刊总数从145种增加到178种。设置4个一级主题：应用科学（Applied sciences）、健康科学（Health sciences）、自然科学（Natural sciences）、社会科学（Social sciences）。其中自然科学一级主题包含生物科学（Biological sciences）、化学（Chemistry）、地球与环境科学（Earth & environmental sciences）、物理学（Physical sciences）4个二级主题。

自然指数有两个重要指标，一是Count（以下称为“论文数”），是指每篇文章只要有一位作者来自某个国家/地区或机构，其所属的国家/地区或机构即获得1分。二是Share（以下称为“贡献份额”），是自然指数的标志性指标，为统计一个机构或国家/地区对某篇论文的贡献，并确保不会重复计算，自然指数使用此指标。由于自然指数每篇论文总分值为1，对于隶属于多个机构的作者，其贡献份额需在各机构间平均分配。